Riassunto analitico
L’attuale interesse, sia clinico che epidemiologico, per le patologie sostenute dai micobatteri non tubercolari (MNT), in particolar modo per quelle attribuibili alle specie ascritte al Mycobacterium avium complex (MAC) è notevolmente accresciuto e questo corrisponde a richieste diagnostiche sempre maggiori. L’identificazione mediante l’uso di sonde molecolari specie-specifiche disponibili in commercio presenta delle limitazioni riguardo all’identificazione delle specie appartenenti al MAC soprattutto per quanto riguarda il M. intracellulare. In questo lavoro di tesi, attraverso uno studio molecolare retrospettivo riguardante il periodo 2008–2013, 559 ceppi di MNT isolati da campioni clinici sono stati identificati con l’ausilio del test molecolare Genotype®Mycobacterium CM/AS. I ceppi identificati come M. intracellulare e M. avium/M. intracellulare sono stati sottoposti in seguito al sequenziamento nucleotidico della sequenza spaziatrice non codificante ITS-1, che è la regione maggiormente utilizzata a scopo tassonomico per l’identificazione delle specie appartenenti al MAC isolate da campioni clinici. L'analisi molecolare effettuata con il kit commerciale descrive un quadro epidemiologico caratterizzato da una maggiore presenza di M. intracellulare rispetto al M. avium (68.9% vs. 31.6%). Tale risultato è stato completamente modificato con il sequenziamento nucleotidico di ITS-1 in quanto si osserva un decremento della percentuale di ceppi MAC identificati come M. intracellulare dal 68.9% (124/180) al 12.2% (22/180). Inoltre è stato possibile evidenziare la presenza di altre specie appartenenti al MAC che non sono ancora state descritte nella nostra area geografica, quali M. chimaera, M. marseillense, M. bouchedurhonense e M. yongonense. Nonostante l’analisi della regione ITS-1 abbia permesso di trovare una precisa collocazione tassonomica per circa 70% dei ceppi appartenenti al MAC presenti nella nostra popolazione nel periodo 2008-2013, resta una quota non trascurabile di ceppi i identificati come MAC senza una precisa identificazione di specie che dovranno essere indagati con il sequenziamento di altri geni.
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